Die Conterganstiftung erbringt im gesetzlichen Auftrag Leistungen für Menschen, deren Behinderung auf thalidomidhaltige Präparate der Grünenthal GmbH zurückzuführen ist. Sie ist verantwortlich für die Auszahlung von Renten und Leistungen für spezifische Bedarfe. Die Stiftung bearbeitet Neu-, Revisions- und Kapitalisierungsanträge und berät die contergangeschädigten Menschen.

Mit Mitteln der Stiftung werden Forschungsvorhaben zur Unterstützung der Teilhabe der contergangeschädigten Menschen am gesellschaftlichen Leben und zur Milderung der Beeinträchtigungen, die durch Spätfolgen hervorgerufen werden, gefördert.